Miller, 41 ans, est l'un des plus proches collaborateurs de Trump depuis plus d'une décennie et constitue la voix la plus puissante et la plus intransigeante du président sur l'immigration. Il porte également le titre de conseiller à la sécurité intérieure.
Trump a annoncé le changement vendredi alors que Wiles s'apprêtait à quitter le poste le même jour.
Les démocrates ont déjà indiqué qu'ils traiteront cette nomination comme un combat autour du bilan de l'administration en matière d'immigration, y compris les fusillades de Minneapolis et les tactiques utilisées lors des raids.
Miller a joué un rôle déterminant dans la conduite du programme d'expulsions massives pendant le second mandat de Trump, une campagne souvent marquée par des raids violents menés par des agents masqués.
Le double rôle de Miller en tant que conseiller à la sécurité intérieure l'a étroitement lié à la campagne d'expulsions qui a défini une grande partie du second mandat.
Il a fait l'objet de critiques particulières après que des agents de l'immigration ont abattu deux manifestants à Minneapolis en janvier. Ces incidents ont déclenché des manifestations de masse.
Le principal démocrate du Sénat américain a juré vendredi de s'opposer vigoureusement à la nomination de Miller.
Wiles, 69 ans, qui a récemment déclaré avoir reçu le feu vert après un cancer du sein, a indiqué dans un communiqué sur X que vendredi serait son dernier jour.